Mikkjal Thomassen, född måndagen den 12 januari 1976 på Landssjukhuset i Tórshavn på Färöarna, inledde sin tränarkarriär i B36 Tórshavn och har därefter varit chefstränare i KÍ Klaksvik och Fredrikstad FK. Mikkjal spelade fotboll i fyra olika klubbar på Färöarna och hans position på planen var först i en offensiv roll innan han började spela i en mer defensiv roll. HB Tórshavn, B36 Tórshavn, B68 Toftir och EB/Streymur var klubbarna mellan 1994 och 2008 då han på grund av problem med en hälsena avslutade spelarkarriären. Det blev även 13 officiella landskamper från start för det färöiska A-landslaget mellan 2006 och 2008, men även några inofficiella 1997-1998 under ledning av den danske förbundskaptenen Allan Simonsen.

Den officiella landslagsdebuten skedde den 7 oktober 2006 då Färöarna inför 1 982 åskådare hemma på Tórsvøllur i Tórshavn mötte Litauen (0–1) i EM-kvalet inför huvudturneringen i Österrike och Schweiz sommaren 2008. Mikkjal Thomassen spelade hela matchen under ledning av förbundskaptenen Jógvan Martin Olsen och hemmanationen var på väg mot en poäng, men i den 89:e matchminuten avgjorde Andrius Skerla för Litauen. Den 13:e och sista landskampen spelade Mikkjal Thomassen i VM-kvalet hemma på Tórsvøllur mot Österrike (1–1) den 11 oktober 2008 då han startade matchen, men tvingades på grund av en skada ersättas av Fróði Benjaminsen i den 37:e matchminuten.

Efter avslutad spelarkarriär inledde Mikkjal Thomassen 2009 sin tränarkarriär i B36 Tórshavn och två år senare vann laget det inhemska mästerskapet Vodafonedeildin. Den 17 mars 2012 spelades den färöiska supercupen ”Stórsteypadystur” mellan ligamästaren och cupmästaren, som introducerades 2007, då EB/Streymur och B36 Tórshavn möttes inför endast 200 åskådare på Gundadalur i Tórshavn och EB/Streymur vann efter ett 2–1-mål i den 93:e matchminuten. Efter fem år i B36 Tórshavn tog Mikkjal 2014 ett sabbatsår för att genomgå en civil ledarutbildning i Köpenhamn. Inför säsongen 2015 skrev Mikkjal Thomassen på ett avtal med KÍ Klaksvík och första säsongen slutade med en femteplats i Effodeildin, vilket sedan 2012 var det nya namnet på högstaligan på Färöarna.

2016 blev det en andraplats i tabellen, då man slutade en poäng efter Víkingur Gøta efter att KÍ lett serien i 13 omgångar, men med tre omgångar kvar gick Víkingur Gøta om. I den inhemska cupen 2016, Løgmanssteypið, tog sig KÍ till final efter att i semifinalens dubbelmöte ha slagit ut NSÍ Runavík med sammanlagt 4–1. Finalen spelades den 27 augusti 2016 mot Víkingur Gøta inför 4 652 åskådare på Tórsvøllur, och ställningen efter ordinarie tid och förlängning var 1–1. KÍ var bäst från elvameterspunkten och vann straffläggningen med 5–3, cuptiteln var den sjätte genom tiderna för KÍ som blev cupmästare för första gången 1966. Andraplatsen i ligan 2016 gav en plats i den första kvalomgången till Uefa Europa League 2017/2018 och när lottningen var gjord i schweiziska Nyon så stod det klart att laget skulle ställas mot AIK.

Den 29 juni 2017 möttes KÍ Klaksvík och AIK i det första mötet på Gundadalur inför 1 374 åskådare och matchen slutade 0–0. I returen på Friends Arena i Solna inför 6 257 åskådare den 6 juli 2017 vann AIK med 5–0 efter mål av Eero Markkanen (3), Stefan Ishizaki och Kristoffer Olsson i den första halvleken. När Effodeildin summerades i oktober 2017 stod det klart att Víkingur Gøta försvarade sin mästartitel med liten marginal. Både Víkingur Gøta och KÍ Klaksvík slutade på 52 poäng, men KÍ hade fem mål sämre målskillnad. Tävlingssäsongen inleddes tidigt och den 4 mars 2017 möttes KÍ och Víkingur Gøta (1–2) i Stórsteypadystur och denna gång föll Mikkjal Thomassens lag i den 89:e matchminuten av supercupen.

2018 blev det en fjärdeplats för KÍ i högstaligan, som inför säsongen bytt namn till Betri deildin menn. 2019 vann KÍ ligan för 18:e gången genom tiderna då man spelade ihop 66 poäng på de 27 matcherna. Man slutade tre poäng före tvåan B36 Tórshavn efter att de två topplagen förlorat mot varandra på hemmaplan under säsongen. 2020 lyckades KÍ inte upprepa ligasegern då man slutade på tredje plats i tabellen, sju poäng efter Havnar Bóltfelag. I kvalet till Uefa Champions League 2020/2021 under augusti 2020 tilldömdes KÍ en 3–0-seger över ŠK Slovan Bratislava av Uefa då de slovakiska gästerna hade spelare som testades positivt för covid-19 och matchen kunde efter två försök därför inte spelas. I den andra kvalomgången slogs KÍ ut av schweiziska BSC Young Boys inför tomma läktare på Stadion Wankdorf i Bern. Förlusten innebar att KÍ hamnade i den tredje kvalomgången i Uefa Europa League 2020/2021 och där vann man med 6–1 mot FC Dinamo Tbilisi från Georgien. I Play off den 1 oktober 2020 väntade Dundalk FC från Irland på bortaplan. Enkelmötet spelades inför tomma läktare på Aviva Stadium i Dublin och hemmalaget vann med 3–1. I supercupen den 3 mars 2020 vann KÍ över Havnar Bóltfelag efter straffsparksläggning då resultatet var 1–1 efter ordinarie tid och förlängning.

2021 blev KÍ återigen mästare på Färöarna under Mikkjal Thomassens ledning då man svarade för en oerhört stark säsong och spelade in 72 poäng på de 27 matcherna. Man noterade 23V-3O-1F i serien och slutade med 99–12 i målskillnad, där den enda förlusten kom borta mot serietvåan Havnar Bóltfelag (1–2). Säsongen 2022 blev än bättre och KÍ spelade in hela 77 poäng efter resultatraden 25V-2O-0F och målskillnaden 78–7. KÍ slutade hela 19 poäng före tvåan Víkingur Gøta. I kvalet till Uefa Champions League 2022/2023 ställdes KÍ mot norska FK Bodø/Glimt i den första kvalomgången och efter 0–3 i första matchen på Aspmyra Stadion i Bodø så blev det 3–1 till KÍ i returen på Injector Arena i Klaksvík och sammanlagd förlust med 3–4. KÍ fortsatte kvalspelet i Uefa Europa Conference League 2022/2023 och ställdes i den andra omgången mot FK Sutjeska Nikšić från Montenegro där det färöiska laget vann med sammanlagt 1–0. I den tredje kvalomgången ställdes KÍ mot FC Ballkani från Kosovo och det blev en rysare. Efter sammanlagt 4–4 efter dubbelmötet blev det straffsparkar inför 1 666 åskådare på Tórsvøllur den 11 augusti 2022. Gästerna vann till slut straffavgörandet med 4–3 och KÍ slogs därmed ut.

Den 27 februari 2022 vann KÍ supercupen inför 500 åskådare på Tórsvøllur då man besegrade B36 Tórshavn med 3–1. Segern var den andra i supercupen för KÍ.

Efter åtta år i KÍ Klaksvík var det dags för det första internationella tränaruppdraget då norska Fredrikstad FK fick Mikkjal Thomassens underskrift på ett kontrakt i slutet av 2022. Fredrikstad FK hade 2022 slutat på tionde plats i OBOS-ligaen, andradivisionen i Norge, men under Mikkjal Thomassens ledning vann man OBOS-ligaen 2023 och tog därmed klivet upp i Eliteserien. FFK slutade 2023 sex poäng före KFUM Oslo, moderklubben för AIK Fotbolls tidigare chefstränare Henning Berg, som också tog klivet upp i seriesystemet. Comebacken i den norska högstaligan skedde den 1 april 2024 då FFK tog emot de regerande norska mästarna FK Bodø/Glimt (0–2) inför 10 691 åskådare hemma på Fredrikstad stadion.

Den första segern i Eliteserien noterade Mikkjal Thomassen i den andra omgången den 7 april 2024 då FFK mötte SK Brann (2–0) inför 16 287 åskådare på Brann stadion efter två mål av Stian Stray Molde. Efter 14 spelade omgångar av Eliteserien 2024 låg Fredrikstad FK på femte plats i en haltande tabell.